Con la Revolución de 1955 la U.D.A. no corrió distinta suerte que las demás Organizaciones Sindicales y comenzó a sufrir persecuciones y arbitrariedades, a tal punto que el 27 de junio de 1.958, por Resolución D.N.I.T.A. Nº82, fue cancelada su Personería Gremial. Pero, ante la imperiosa necesidad de agremiación en un sindicato legalmente constituido, el 20 de enero de 1973 se reúne en la ciudad de Buenos Aires una Asamblea integrada por un grupo de docentes que decidieron reorganizar la Unión.

Nuevamente, tras el golpe militar de 1.976, por Resolución M. T. Nº 4 del Ministerio de Trabajo de la Nación, del 2 de Abril de 1.976, se dispone la intervención de la U.D.A. por lo que la Comisión Directiva cesa en sus funciones el 6 de abril. Esto duró hasta el 7 de Abril de 1.983, cuando por Resolución Nº 152/83 del Ministerio de Trabajo, se pone en posesión de los cargos a los miembros de una Comisión Transitoria.